Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms