Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms