Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.5 ms