Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms