Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms