Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms