Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms