Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54lP70270 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms