Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms