Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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