Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx1P63006 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx1P63006 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx1P63006 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx1P63006 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx1P63006 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx1P63006 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx1P63006 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx1P63006 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx1P63006 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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