Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rpl18aP62717 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms