Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rps29P62274 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms