Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp46P62069 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp46P62069 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp46P62069 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp46P62069 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp46P62069 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp46P62069 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp46P62069 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms