Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms