Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms