Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem258P61166 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem258P61166 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms