Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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