Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chp1P61022 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp1P61022 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp1P61022 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms