Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms