Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdo1P60334 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdo1P60334 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms