Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3eP60229 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms