Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms