Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrnp3P59055 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms