Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms