Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms