Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf2P58021 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms