Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmoP56726 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmoP56726 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms