Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms