Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtskP55097 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtskP55097 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtskP55097 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtskP55097 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtskP55097 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms