Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms