Protein–RNA interactions for Protein: P53784

Sox3, Transcription factor SOX-3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox3P53784 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox3P53784 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox3P53784 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms