Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RabggtbP53612 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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RabggtbP53612 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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RabggtbP53612 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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RabggtbP53612 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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RabggtbP53612 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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