Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux1P53564 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux1P53564 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms