Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms