Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms