Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr5P51682 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms