Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TspoP50637 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TspoP50637 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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