Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TubP50586 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TubP50586 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TubP50586 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TubP50586 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TubP50586 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TubP50586 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms