Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms