Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms