Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CitP49025 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CitP49025 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CitP49025 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CitP49025 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CitP49025 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CitP49025 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CitP49025 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CitP49025 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CitP49025 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CitP49025 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CitP49025 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CitP49025 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CitP49025 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CitP49025 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms