Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnni3P48787 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms