Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd1P48410 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms