Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VdrP48281 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VdrP48281 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms