Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx2P48031 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbx2P48031 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbx2P48031 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms