Protein–RNA interactions for Protein: P47801

Emp1, Epithelial membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp1P47801 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp1P47801 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emp1P47801 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms