Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms