Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ItgavP43406 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms