Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx2P43241 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx2P43241 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms